沼气发电机组的机房应该宽敞、明亮、远离明火区域，并且要求安装换气扇以保证良好的通风，应安装避雷装置，应安装燃气泄漏报警装置，室内安装照明、开关、线路及其电器应采用防爆措施，且固定牢靠，配备灭火器等消防器械。
使用优良的空气滤清器、机油过滤器能使发动机更可靠的工作，并且能延长沼气发电机组的使用寿命。严禁沼气发电机组在未安装空气滤清器的情况下工作，严禁未过滤气体进入发动机气缸中。必须使用符合指定标准的燃气、润滑油，并且必须过滤和清洗其通过的管路或容器。电气系统各部分的检查和操作必须由熟悉电工知识的技术人员进行，沼气发电机组的油封期为一年，超过油封期后必须进行拆检后才能使用。
沼气发电机组的工作环境条件为海拔高度2500米以下，空气温度范围从5℃至35℃。燃料和机油的质量、环境条件，沼气发电机组负荷的因素以及安装和维护的质量影响沼气发电机组的使用寿命。为了充分发挥沼气发电机组的潜力，必须重视这些因素的影响。
